Wojciechowski urodził się w 1954 roku w Rawie Mazowieckiej. Jego rodzice mieli tam 10-hektarowe gospodarstwo. W 1977 roku ukończył Wydział Prawa i Administracji Uniwersytetu Łódzkiego. Po studiach odbył aplikację prokuratorską w prokuraturze w Rawie Mazowieckiej. Następnie pokonywał kolejne szczeble kariery prawniczej.
Był sędzią Sądu Rejonowego w Rawie Mazowieckiej, potem kolejno Sądu Wojewódzkiego w Skierniewicach i Sądu Apelacyjnego w Warszawie. W latach 1990-1991 orzekał również w Sądzie Najwyższym jako sędzia delegowany. W okresie 1990-1993 pełnił z wyboru mandat członka Krajowej Rady Sądownictwa.
W wyborach parlamentarnych 1993 roku startował z listy PSL jako kandydat bezpartyjny z ówczesnego województwa skierniewickiego.
W czerwcu 1995 roku wybrany został na 6-letnią kadencję prezesa NIK. Pod jego przewodnictwem NIK budowała wizerunek instytucji walczącej z korupcją. W marcu 2000 r. opracowała pierwszy raport dotyczący mechanizmów korupcjogennych w Polsce. Wojciechowski był prezesem NIK do lipca 2001 roku.
W latach 2001-2004 był wicemarszałkiem Sejmu. W czerwcu 2004 roku wybrano go do PE z listy PSL. Od marca 2004 roku do stycznia 2005 był prezesem Stronnictwa.
Na początku 2006 r. Wojciechowski i dwaj inni europosłowie: Zdzisław Podkański i Zbigniew Kuźmiuk zostali usunięci z PSL.
Przyczyną była - według liderów PSL - zmiana przez europosłów frakcji w Parlamencie Europejskim - bez zgody władz partii, a także próby tworzenia przez nich nowej partii, bliskiej PiS. Eurodeputowani powołali Polskie Stronnictwo Ludowe Piast.
Wojciechowski ma 55 lat, jest żonaty, ma dwóch synów. Zna biegle angielski i rosyjski. Prowadzi też swój blog, na którym często pisze wiersze. (PAP)